發(fā)布時間：2021-12-21 21:47:42  訪問次數(shù)：478

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中國農(nóng)業(yè)科學院科研人員開發(fā)出首款茶樹高密度 SNP 芯片

近日，中國農(nóng)業(yè)科學院茶葉研究所茶樹遺傳育種團隊基于“龍井 43”基因組參考序列和茶樹重測序數(shù)據(jù)，開發(fā)出一款 200K 茶樹 SNP 芯片。相關研究成果在《植物生物技術雜志(Plant Biotechnology Journal)》上發(fā)表。

　　該芯片是首款茶樹高密度 SNP 芯片，以“龍井 43”(雌性)和“白毫早”(雄性)F1 群體為材料，該芯片能夠?qū)?18226 個 SNP 位點繪入圖譜，獲得 5325 個 bin-marker，連鎖圖譜總長度為 2107.01 厘摩，相鄰標記平均遺傳圖距為 0.39 厘摩，構(gòu)建了目前遺傳密度最高的連鎖圖譜。

　　實驗驗證表明，該芯片可以有效定位關鍵 QTL 位點，發(fā)掘茶樹重要功能基因。利用其對不同茶樹品種的 SNP 分型研究，發(fā)現(xiàn)茶樹大葉種和小葉種之間的兩個強選擇位點，對揭示茶樹品質(zhì)調(diào)控關鍵基因和兩個變種間的進化關系具有重要意義。

　　該研究得到國家重點研發(fā)項目、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、國家自然科學基金等項目的支持。